Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASC4Q6P4E1 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASC4Q6P4E1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASC4Q6P4E1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASC4Q6P4E1 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASC4Q6P4E1 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CASC4Q6P4E1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASC4Q6P4E1 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASC4Q6P4E1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASC4Q6P4E1 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASC4Q6P4E1 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASC4Q6P4E1 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASC4Q6P4E1 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CASC4Q6P4E1 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASC4Q6P4E1 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASC4Q6P4E1 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASC4Q6P4E1 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms