Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms