Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RNF212Q495C1 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms