Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
VWC2Q2TAL6 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VWC2Q2TAL6 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VWC2Q2TAL6 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VWC2Q2TAL6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VWC2Q2TAL6 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VWC2Q2TAL6 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VWC2Q2TAL6 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VWC2Q2TAL6 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VWC2Q2TAL6 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VWC2Q2TAL6 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VWC2Q2TAL6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VWC2Q2TAL6 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms