Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms