Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFKFB3Q16875 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms