Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRNQ16849 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRNQ16849 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRNQ16849 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRNQ16849 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRNQ16849 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRNQ16849 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRNQ16849 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRNQ16849 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRNQ16849 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRNQ16849 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRNQ16849 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRNQ16849 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRNQ16849 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRNQ16849 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRNQ16849 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRNQ16849 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRNQ16849 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRNQ16849 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRNQ16849 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRNQ16849 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRNQ16849 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRNQ16849 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRNQ16849 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms