Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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