Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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HERC3Q15034 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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HERC3Q15034 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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