Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms