Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1SQ13698 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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