Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ATRQ13535 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
ATRQ13535 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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