Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PMS2P3Q13401 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PMS2P3Q13401 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PMS2P3Q13401 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PMS2P3Q13401 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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