Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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