Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms