Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms