Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARDQ03181 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms