Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms