Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD83Q01151 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD83Q01151 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CD83Q01151 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD83Q01151 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD83Q01151 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD83Q01151 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD83Q01151 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD83Q01151 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CD83Q01151 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD83Q01151 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CD83Q01151 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD83Q01151 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CD83Q01151 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms