Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms