Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMF1P82094 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMF1P82094 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMF1P82094 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms