Protein–RNA interactions for Protein: P80723

BASP1, Brain acid soluble protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BASP1P80723 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BASP1P80723 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BASP1P80723 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BASP1P80723 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BASP1P80723 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BASP1P80723 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BASP1P80723 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BASP1P80723 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BASP1P80723 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BASP1P80723 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BASP1P80723 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BASP1P80723 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BASP1P80723 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BASP1P80723 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BASP1P80723 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BASP1P80723 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BASP1P80723 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BASP1P80723 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BASP1P80723 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BASP1P80723 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BASP1P80723 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BASP1P80723 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms