Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ERVS71-1P61550 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms