Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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ACTBP60709 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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ACTBP60709 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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ACTBP60709 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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ACTBP60709 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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ACTBP60709 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ACTBP60709 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ACTBP60709 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ACTBP60709 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ACTBP60709 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ACTBP60709 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
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