Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms