Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMPOP42166 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMPOP42166 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPOP42166 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPOP42166 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms