Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
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