Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms