Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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CXCL2P19875 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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CXCL2P19875 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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CXCL2P19875 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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CXCL2P19875 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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CXCL2P19875 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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CXCL2P19875 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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CXCL2P19875 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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CXCL2P19875 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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