Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms