Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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