Protein–RNA interactions for Protein: H3BQ06

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQ06 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BQ06 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BQ06 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3BQ06 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3BQ06 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3BQ06 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3BQ06 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3BQ06 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3BQ06 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3BQ06 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3BQ06 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3BQ06 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3BQ06 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3BQ06 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BQ06 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.5 ms