Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms