Protein–RNA interactions for Protein: R4GN57

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GN57 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R4GN57 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
R4GN57 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
R4GN57 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R4GN57 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R4GN57 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R4GN57 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R4GN57 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R4GN57 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R4GN57 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R4GN57 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R4GN57 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R4GN57 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R4GN57 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R4GN57 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R4GN57 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
R4GN57 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
R4GN57 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
R4GN57 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
R4GN57 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
R4GN57 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R4GN57 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R4GN57 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R4GN57 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R4GN57 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R4GN57 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R4GN57 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R4GN57 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R4GN57 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R4GN57 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
R4GN57 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
R4GN57 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R4GN57 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R4GN57 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R4GN57 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R4GN57 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R4GN57 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R4GN57 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R4GN57 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R4GN57 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
R4GN57 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R4GN57 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R4GN57 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R4GN57 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R4GN57 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R4GN57 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
R4GN57 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
R4GN57 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R4GN57 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R4GN57 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R4GN57 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R4GN57 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R4GN57 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
R4GN57 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R4GN57 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R4GN57 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R4GN57 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R4GN57 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R4GN57 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R4GN57 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R4GN57 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R4GN57 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R4GN57 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
R4GN57 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R4GN57 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
R4GN57 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R4GN57 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R4GN57 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R4GN57 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R4GN57 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R4GN57 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R4GN57 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R4GN57 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R4GN57 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
R4GN57 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R4GN57 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R4GN57 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R4GN57 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R4GN57 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R4GN57 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R4GN57 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R4GN57 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R4GN57 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R4GN57 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R4GN57 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R4GN57 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R4GN57 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R4GN57 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R4GN57 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R4GN57 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R4GN57 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R4GN57 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R4GN57 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R4GN57 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R4GN57 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R4GN57 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R4GN57 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R4GN57 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R4GN57 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R4GN57 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms