Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX13Q9Y5W8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX13Q9Y5W8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
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