Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CD2APQ9Y5K6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD2APQ9Y5K6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD2APQ9Y5K6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD2APQ9Y5K6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD2APQ9Y5K6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD2APQ9Y5K6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD2APQ9Y5K6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD2APQ9Y5K6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CD2APQ9Y5K6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD2APQ9Y5K6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CD2APQ9Y5K6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD2APQ9Y5K6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD2APQ9Y5K6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CD2APQ9Y5K6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD2APQ9Y5K6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD2APQ9Y5K6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD2APQ9Y5K6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD2APQ9Y5K6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD2APQ9Y5K6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CD2APQ9Y5K6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CD2APQ9Y5K6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms