Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB2Q9Y5E7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB2Q9Y5E7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB2Q9Y5E7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB2Q9Y5E7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms