Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.79■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.79■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
WASHC2CQ9Y4E1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms