Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX24Q9Y343 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX24Q9Y343 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms