Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP20Q9Y2K6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms