Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BTRCQ9Y297 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BTRCQ9Y297 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms