Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITM2BQ9Y287 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITM2BQ9Y287 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms