Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFSF13BQ9Y275 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFSF13BQ9Y275 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms