Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUDCQ9Y266 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NUDCQ9Y266 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NUDCQ9Y266 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms