Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP2BQ9UQN3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms