Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
AGTPBP1Q9UPW5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AGTPBP1Q9UPW5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
AGTPBP1Q9UPW5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGTPBP1Q9UPW5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGTPBP1Q9UPW5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGTPBP1Q9UPW5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGTPBP1Q9UPW5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGTPBP1Q9UPW5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGTPBP1Q9UPW5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGTPBP1Q9UPW5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGTPBP1Q9UPW5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGTPBP1Q9UPW5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGTPBP1Q9UPW5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGTPBP1Q9UPW5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AGTPBP1Q9UPW5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AGTPBP1Q9UPW5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms