Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGAP1Q9UPQ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGAP1Q9UPQ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms