Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms