Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BARX2Q9UMQ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BARX2Q9UMQ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BARX2Q9UMQ3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BARX2Q9UMQ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BARX2Q9UMQ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BARX2Q9UMQ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BARX2Q9UMQ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BARX2Q9UMQ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BARX2Q9UMQ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BARX2Q9UMQ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BARX2Q9UMQ3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BARX2Q9UMQ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BARX2Q9UMQ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BARX2Q9UMQ3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BARX2Q9UMQ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BARX2Q9UMQ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms