Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CIZ1Q9ULV3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CIZ1Q9ULV3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CIZ1Q9ULV3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CIZ1Q9ULV3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CIZ1Q9ULV3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CIZ1Q9ULV3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CIZ1Q9ULV3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CIZ1Q9ULV3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CIZ1Q9ULV3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms